本文根据东京医科齿科大学成果发布编译而成
东京医科齿科大学研究生院医齿学综合研究科病毒控制学领域的武内宽明讲师与医学部附属医院院长助理、难治疾病研究所基因组解析室的谷本幸介助教及Research Core Center的田中Yuki助教等人组成的负责对该校附属医院住院患者的SARS-CoV-2基因组实施分析的项目组,通过与该校理事、副校长兼综合研究机构主任木村彰方和医学附属医院感染控制部部长贯井质子共同进行分析发现,2020年秋季以后在该校附属医院住过院或者就过诊的COVID-19患者中,各种海外毒株的感染病例增加;另外还发现,其中一种海外毒株携带“免疫逃逸型突变(E484K突变)”,而且已导致多起社区获得性感染。
2020年11月以后,日本的新冠病毒感染症(COVID-19)病例迅速增加,从2020年12月下旬开始,传染性已被证明增强的英国型突变株(B.1.1.7毒株)、南非型突变株(B.1.351毒株)及巴西型突变株(P.1毒株)逐渐在日本国内出现。自2021年1月以来,已检测出多例B.1.1.7毒株的社区获得性感染病例,因此政府需要采取更严格措施来预防感染蔓延。
东京医科齿科大学在2020年11月下旬至12月下旬发现了疑似从海外进入日本的3种英国毒株(B.1.1.4毒株、B.1.1.166毒株、B.1.1.220毒株)感染病例,此前已报告过这些感染病例属于社区获得性感染(keguanjp.com/kgjp_keji/kgjp_kj_smkx/pt20210205000004.html)。此次为其后续报告,研究团队从2020年12月下旬至2021年1月中旬在该校附属医院住过院或者就过诊的11例患者样本中,发现了与上次报告的病例不同的海外毒株(B.1.1.130毒株、B.1.1.64毒株、B.1.346毒株、B.1.316毒株)感染病例。另一方面,发现2020年底以前检测出的日本毒株(B.1.1.214及B.1.1.284两种毒株)感染病例在逐渐减少。另外还发现,此次确认的海外毒株中有一种携带“免疫逃逸型突变(E484K突变)”。该毒株已发现有3例感染患者,且均无海外旅行史或相互接触史。
表:东京医科齿科大学在2020年12月下旬至2021年1月中旬发现的SARS-CoV-2毒株一览
淡蓝色为携带E484K突变的海外毒株
2020年底以后已从东京医科齿科大学的样本中发现多例海外毒株的感染病例,另外,2020年3月及7月以后确认的2种不同的国内流行毒株(B.1.1.214及B.1.1.284两种毒株)在逐渐减少,因此,目前日本国内的流行毒株可能正逐渐变为海外毒株。
此外,具有“免疫逃逸型突变(E484K突变)”的海外毒株不仅有该校确认的B.1.316毒株,日本国立感染症研究所还报告了其他毒株(B.1.1.4突变)也具有这种突变。这些海外毒株虽然没有携带传染性可能增强的突变,但仍要继续观测。
表:携带传染性可能增强的突变和免疫逃逸型突变的SARS-CoV-2毒株一览
·关于毒株谱系
新冠病毒的谱系名称是利用基于全球通用的谱系分类方法Pangolin(COVID-19 Lineage Assigner Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak LINeages)进行分类的。
·免疫逃逸型突变(E484K突变)
E484K突变是在存在COVID-19康复患者血清(含有抑制SARS-CoV-2感染的中和抗体)的情况下,依然保持感染能力的SARS-CoV-2突变,可能会削弱中和抗体的效果。
·加拿大毒株
根据Pangolin谱系分类被定义为B.1.316谱系毒株的SARS-CoV-2,在美国、比利时和加拿大等发现多起感染病例。
·日本毒株
根据Pangolin谱系分类被定义为B.1.214及B.1.284谱系毒株的SARS-CoV-2,90%以上的感染病例发生在日本。
·什么是免疫(基于中和抗体的免疫)逃逸?
日语发布资料
编译:JST客观日本编辑部