客观日本

日本发现英国突变谱系的三种新毒株,或影响新冠在日本的流行趋势

2021年02月05日 生物医药

本文根据东京医科齿科大学成果发布编译而成

东京医科齿科大学研究生院医齿学综合研究科病毒控制学领域的武内宽明讲师与医学部附属医院院长助理、难治疾病研究所基因组解析室的谷本幸介助教及Research Core Center的田中Yukie助教等人组成的项目组通过与该校理事、副校长兼综合研究机构主任木村彰方和医学附属医院感染控制部部长贯井质子合作,对该校附属医院住院患者的SARS-CoV-2基因组进行了解析,发现了此前从未在日本国内流行毒株中发现过的3种新英国毒株。

研究背景

2020年11月以后,日本的新冠病毒感染症(COVID-19)病例迅速增加,从2020年12月开始,因担心传染性已增强的英国SARS-CoV-2突变株(B.1.1.7毒株)及南非新突变株(B.1.351毒株)进入日本国内,日本政府从2020年12月底开始加强了边境检疫对策。

然而,2021年1月不仅发现了B.1.1.7毒株的社区感染病例,还从来自巴西的旅客体内检测出与上述2种突变株拥有相同突变位点的新突变株(B.1.1.248毒株)。这表明,日本已经难以阻止来自海外的各种SARS-CoV-2毒株的入侵。

研究概要

项目组对2020年7月以后在东京医科齿科大学医学部附属医院住过院的COVID-19患者的鼻咽拭子样本中含有的SARS-CoV-2全长基因组序列进行了分析,目的是通过把(1)病毒学特征、(2)COVID-19流行病学数据及(3)临床特征联系起来,为COVID-19的病理调查及公众卫生决策提供依据。

经过解析发现,从2020年11月下旬至12月下旬在该校附属医院住过院的患者样本中发现了3种与日本国内目前的流行毒株(B.1.1.214谱系)和传染性可能增强的SARS-CoV-2新突变株(UK突变株:B.1.1.7谱系、南非突变株:B.1.351谱系、巴西突变株:B.1.1.248谱系)不同的海外毒株,分别为隶属于英国毒株的B.1.1.4谱系、B.1.1.166谱系、B.1.1.220谱系。此次调查检测出上述3种英国毒株的患者均无海外旅行史,因此这些感染病例属于社区获得性感染。

title

表:已发现的SARS-CoV-2毒株一览(红框内为此次确认的3种毒株)

此次新发现的3种英国毒株的社区感染病例可能会影响日本国内目前的流行毒株的变化。另外,有2名感染新发现的英国毒株的患者病情严重,因此新毒株还可能会加重临床症状,不过,目前还难以判断其对传染性、病原性、检查方法及疫苗的影响,需要继续分析和调查。

日语发布资料
编译:JST客观日本编辑部

专题网页