日本农业食品产业技术综合研究机构（以下简称“农研机构”）的西尾元秀主任研究员和石井和雄领域负责人等成功开发了一种可以根据基因组（全基因信息）分析，将黑毛和牛的血缘关系的亲近程度进行数值化的方法。该方法有助于实现血缘关系较远的牛之间的交配，从而防止过度近亲交配带来的发育不良和受孕率降低，保持和牛的繁殖力。
研究团队开发出了防止黑毛和牛近亲交配的方法（供图：日本家畜改良中心）
在以黑毛和牛为代表的肉牛品种改良过程中，由于只使用极少数具有“霜降”等优良肉质的雄性作为种牛，导致拥有相同种牛祖先的牛越来越多，加重了近亲交配的情况。业界担忧从双亲继承了相似基因组的和牛更容易出现不利于发育的缺陷，繁殖能力降低的现象。
生物的遗传信息是由4种碱基的序列决定的。即使是同一物种，序列的微小差异也会导致个体差异。农研机构和日本家畜改良中心的研究团队着眼于黑毛和牛基因组中的“单碱基多态性（SNP）”差异，从3万多个SNP的数据中分析了碱基序列吻合部分的长度，并将血缘关系的亲近程度进行了数值化。研究证实，该方法与传统使用牛谱系信息计算的方法所得到的结果高度一致。
日本的农户通常只能获得牛过去三代的牛谱系信息，因此很难准确判断种牛和母牛之间的血缘关系。而此次开发的新方法即使在没有谱系信息的情况下也能使用。其成本仅1万～2万日元，低于检测对比所有碱基序列的方法。该方法还可应用于猪、羊等其他家畜。
日文：《日本经济新闻》电子版、2024/4/26
中文：JST客观日本编辑部
【论文信息】
杂志：BMC Genomics 24, 376 (2023)
论文：Comparing pedigree and genomic inbreeding coefficients, and inbreeding depression of reproductive traits in Japanese Black cattle
DOI：doi.org/10.1186/s12864-023-09480-5
